1999年，出演由穆宁、牛莉、杨蕊主演的电影《宏志班的故事》，扮演张华。2000年，出演由李湘、侯耀华、史可等主演的电视剧《衣锦还乡》，饰演李赣。同年还在电视剧《蔡希陶》中饰演少年时代的蔡希陶。2001年，出演由冯远征、梅婷、王学兵主演的电视剧《不要和陌生人说话》扮演小警察罗小锣；同年还出演了赵文瑄主演的《钱王》扮演钱王之子王鸿图；参演谢娜、刘烨主演的电视剧《幸福街》。2002年，与段奕宏、裴秀彬、李光洁等共同主演电视剧《记忆的证明》，饰演八路军陈四妹。同年，还出演傅艺伟、宁静、乔振宇等主演的电视剧《新五女拜寿》，在剧中饰演黄小柏。2005年，与陈道明、佟大为、江一燕、张歆艺等共同主演电视剧《我们无处安放的青春》，饰演周离。2006年，在黄晓明、刘亦菲、陈紫函等主演的电视剧《神雕侠侣》中饰演郭靖的弟子武敦儒。2007年，在导演梁耀明执导的电视剧《小李飞刀》中客串店小二。在电影方面，在《天下第二》中饰演肢体语言十分丰富的笨忍者。而在香港导演吴宇森执导的《赤壁》中，王宁饰演汉献帝。2007年，王宁主演宋迪电影《夜班车》。同年参演李少红导演的电视电影《绝对隐私》系列之《人在北京》。2009年，拍摄第一部话剧《索马里海盗》，他在剧中饰演张老师、小贩、小武僧等角色。2010年主演话剧《乌龙山伯爵》，王宁在剧中饰演两个角色，神父和谢蟹。2011年，在话剧《旋转卡门》中饰演怪盗王。9月，和常远、艾伦一同参加第八届CCTV小品大赛，表演小品《落叶归根》，并获得了优秀演员奖，而小品《落叶归根》获得三等奖。2012年，首次登上央视春晚舞台并与蔡明，常远，郭丰周一同表演小品《天网恢恢》。同年，“开心麻花”公司推出全国首部周播网络情景剧《开心麻花剧场》，王宁在剧中饰演归田。2013年，再次登上央视春晚舞台，与艾伦、常远合作表演小品《大城小事》。同年，与吴孟达、刘芸、于谦联袂主演喜剧电影《大片》，在电影中扮演厨师，大展搞笑天赋。2014年，在央视元宵晚会王宁与艾伦、常远合作表演小品《同学会》。同年，与修睿、李乐儿主演由尹琪自编自导都市职场情景喜剧《废柴兄弟》，饰演废柴男许之一。2014年12月24日，由张航导演，王宁，周牧茵，楚轶男，何达，任添琪，李宝儿，玛利亚主演的网络态度喜剧《谁还没点事》在北京举办了新闻媒体发布会，该剧与《废材兄弟》第二季同一档期上映。王宁扮演男主角康小卫。2015年3月5日，在央视元宵晚会与艾伦、常远、冷旭阳合作表演小品《其实你不懂我的心》。7月5日，以胡耀邦为原型的电影《青春激荡的岁月》在湖南浏阳开机，王宁出演胡耀邦。这也是我国首部以胡耀邦同志为主角的电影。12月18日，《废柴兄弟3》在爱奇艺上线播出。2016年1月，与搭档艾伦一起代表开心麻花团队参加东方卫视《欢乐喜剧人》第二季。2月，拍摄由袁杰执导，葛天、来喜等明星加盟的喜剧电影《神话干掉笑话》。5月9日，《废柴兄弟4》上线播出，周一到周四每天12:00更新，转免五天播放量破亿。5月20日，喜剧软科幻电影《小强大战外星人》在重庆开机，王宁饰演男主角杨小强。6月7日，随着最新一集的转免，《废柴兄弟4》播放量已突破3.3亿，四季总播放量达21.19亿。7月8日，由其主演的都市冒险喜剧《发条城市》在中国大陆上映。12月16日，与来喜、黄一飞、连晋共同主演的喜剧电影《咸鱼传奇》。10月22日开始，与郑恺搭档参加浙江卫视的《喜剧总动员》第三赛段。2020年，参演由贾冰、苗圃主演的院线电影《画饼》。2021年2月，加盟东方卫视喜剧节目《欢乐喜剧人第七季》，担任“火龙果队”队长；2月26日，参加《2021年中央广播电视总台元宵晚会》，与蔡明、潘长江等表演小品《彩排》。
